这部电影主要讲的是一个叫麦克。华斯基的小怪物(大眼仔)在怪兽大学里发生的事。麦克小时候去参访怪兽公司时，受到一位惊吓专员的鼓励，从此下定决心要成为一位惊吓专员。他非常努力读书，终于成功进入怪兽大学后，但是因为个子矮小外形不可怕，饱受别人的看不起和嘲笑。为了证明自己，他加入了整个大学最差的一个团队ok社，以此来参加学校所举办的怪兽惊吓杯大赛。最后，麦克用他的智慧和所学出色地领导这个团队夺得了惊吓杯。同时，麦克还和一个叫苏利文的大毛怪成了好朋友。尽管最后麦克和苏利文被怪兽大学开除了，但它们最终如愿以偿地成为怪兽公司的一员。

电正好，学校里开了恐吓课程，于是麦克和苏利就开始了对“恐吓王”头衔的争夺。可是好景不长，因为阴差阳错的误会，它们两个都被这门课的老师－－怪兽大学的校长开除出了恐吓课程，而苏利也被自己的社团开除。无奈之下，麦克找到苏利交心，它说自己之所以要去学习恐吓，是为了向世界展示自己的能力，他赢得了苏利的同情。于是，麦克就去到了校长，希望能重新回到课堂上，并且，它还愿意参加令人闻风丧胆的“恐怖游戏”。不过，麦克的此举遭到了几乎所有学生的排挤。不过，希望还是渐渐显现了出来。麦克加入了一个社团，他希望通过这个社团的集体的力量，让自己参与到“恐怖游戏”之中。不过，这个社团实在是缺兵少将，他们还需要一个参赛者才能达到最低报名人数。就在这时，麦克拉来了自己的死对头苏利。而且，它还向校长保证，如果它在游戏中失利，就将离开怪兽大学。